O Major, então, pensa que está tendo alucinações devido a queda da espaçonave, mas, na verdade, ele havia encontrado um gênio aprisionado há centenas de anos, por um outro gênio maligno. Preocupado com sua saída da ilha deserta, Anthony esquece da garrafa, porém, Jeannie usa seu poder e coloca a garrafa na bagagem do Major, antes de ele ser salvo pela equipe de resgate.

Jeannie acaba se apaixonado por Anthony e passa a chamá-lo de “amo”. No começo, ele tentar livrar-se dela, em vão, e aos poucos perceve que não pode viver sem ela, mesmo que isso represente uma série de confusões para a vida dele.

O Major prefere que ela não faça uso de seus poderes mágicos e procura esconder sua verdadeira identidade de todos os amigos — e de todos os seres humanos. Sempre que Jeannie usa suas mágicas, Anthony fica quase sem saída para explicar a confusão, principalmente para o Dr. Bellows, o psicanalista da base de operações da NASA, que tenta descobrir a causa das coisas estranhas que passam a acontecer quando o Major está por perto.